goatools.anno.init package

Submodules

• goatools.anno.init.reader_gaf module
  • InitAssc
    • InitAssc.init_associations()
  • GafData
    • GafData.spec_req1
    • GafData.aspect2ns
    • GafData.gafhdr
    • GafData.gafhdr2
    • GafData.gafhdr_ext
    • GafData.gaf_req_str
    • GafData.gaf_req_str_2_2
    • GafData.gaf_required_columns
    • GafData.gaf_columns
    • GafData.get_dfltdict()
    • GafData.chk()
    • GafData.get_ntobj()
    • GafData.get_gafvals()
    • GafData.prt_line_detail()
    • GafData.prt_error_summary()
  • GafHdr
    • GafHdr.cmpline
    • GafHdr.get_hdr()
    • GafHdr.chkaddhdr()
    • GafHdr.validate()
• goatools.anno.init.reader_genetogo module
  • InitAssc
    • InitAssc.taxid_dflt
    • InitAssc.hdrs
    • InitAssc.flds
    • InitAssc.init_associations()
• goatools.anno.init.reader_gpad module
  • InitAssc
    • InitAssc.gpadhdr
    • InitAssc.exp_numcol
    • InitAssc.exp_qualifiers
    • InitAssc.relation2qualifier
    • InitAssc.cmpver
    • InitAssc.init_associations()
  • GpadHdr
    • GpadHdr.cmpline
    • GpadHdr.get_hdr()
    • GpadHdr.chkaddhdr()
• goatools.anno.init.reader_idtogos module
  • InitAssc
    • InitAssc.flds
    • InitAssc.init_associations()
• goatools.anno.init.utils module
  • get_date_yyyymmdd()

Module contents

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